Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp47Q8BY87 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
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