Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms