Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms