Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms