Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms