Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp54Q8BL06 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms