Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnrc6bQ8BKI2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms