Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms