Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms