Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms