Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms