Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TnnQ80Z71 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TnnQ80Z71 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms