Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
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Npm2Q80W85 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
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Npm2Q80W85 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
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Npm2Q80W85 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
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Npm2Q80W85 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
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Npm2Q80W85 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
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Npm2Q80W85 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
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Npm2Q80W85 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
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Npm2Q80W85 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
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Npm2Q80W85 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Npm2Q80W85 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
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