Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll4Q80V24 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms