Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube3cQ80U95 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms