Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prrc2bQ7TPM1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms