Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HhipQ7TN16 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
HhipQ7TN16 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HhipQ7TN16 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HhipQ7TN16 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HhipQ7TN16 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HhipQ7TN16 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HhipQ7TN16 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HhipQ7TN16 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HhipQ7TN16 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HhipQ7TN16 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HhipQ7TN16 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HhipQ7TN16 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HhipQ7TN16 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HhipQ7TN16 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HhipQ7TN16 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HhipQ7TN16 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HhipQ7TN16 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HhipQ7TN16 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms