Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms