Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nme8Q715T0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme8Q715T0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nme8Q715T0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme8Q715T0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms