Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ncapd3Q6ZQK0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms