Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Topbp1Q6ZQF0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms