Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rhox8Q6VSS7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Rhox8Q6VSS7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rhox8Q6VSS7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rhox8Q6VSS7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rhox8Q6VSS7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rhox8Q6VSS7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rhox8Q6VSS7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rhox8Q6VSS7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rhox8Q6VSS7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms