Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ift172Q6VH22 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms