Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timd4Q6U7R4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timd4Q6U7R4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms