Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms