Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cd300lfQ6SJQ7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms