Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Shc4Q6S5L9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms