Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc154Q6RUT8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms