Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfrlQ6PE55 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms