Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms