Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms