Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trak1Q6PD31 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trak1Q6PD31 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms