Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms