Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nwd2Q6P5U7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nwd2Q6P5U7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nwd2Q6P5U7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nwd2Q6P5U7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nwd2Q6P5U7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nwd2Q6P5U7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nwd2Q6P5U7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nwd2Q6P5U7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nwd2Q6P5U7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nwd2Q6P5U7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Nwd2Q6P5U7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nwd2Q6P5U7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nwd2Q6P5U7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nwd2Q6P5U7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nwd2Q6P5U7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nwd2Q6P5U7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nwd2Q6P5U7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nwd2Q6P5U7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nwd2Q6P5U7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nwd2Q6P5U7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nwd2Q6P5U7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms