Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms