Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms