Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Soga3Q6NZL0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Soga3Q6NZL0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms