Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms