Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SphkapQ6NSW3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SphkapQ6NSW3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms