Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo41Q6NS60 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo41Q6NS60 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo41Q6NS60 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo41Q6NS60 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo41Q6NS60 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo41Q6NS60 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo41Q6NS60 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo41Q6NS60 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo41Q6NS60 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo41Q6NS60 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo41Q6NS60 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo41Q6NS60 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms