Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdcd11Q6NS46 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms