Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gm5416Q6IE28 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gm5416Q6IE28 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gm5416Q6IE28 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm5416Q6IE28 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm5416Q6IE28 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm5416Q6IE28 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm5416Q6IE28 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm5416Q6IE28 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm5416Q6IE28 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm5416Q6IE28 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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