Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9bQ6EBV9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9bQ6EBV9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9bQ6EBV9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9bQ6EBV9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9bQ6EBV9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9bQ6EBV9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9bQ6EBV9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9bQ6EBV9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9bQ6EBV9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9bQ6EBV9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms