Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Smarca2Q6DIC0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Smarca2Q6DIC0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms