Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms