Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ltn1Q6A009 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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Ltn1Q6A009 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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Ltn1Q6A009 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltn1Q6A009 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltn1Q6A009 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltn1Q6A009 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltn1Q6A009 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltn1Q6A009 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Ltn1Q6A009 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltn1Q6A009 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltn1Q6A009 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Ltn1Q6A009 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltn1Q6A009 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltn1Q6A009 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltn1Q6A009 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Ltn1Q6A009 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Ltn1Q6A009 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Ltn1Q6A009 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Ltn1Q6A009 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Ltn1Q6A009 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Ltn1Q6A009 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Ltn1Q6A009 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ltn1Q6A009 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Ltn1Q6A009 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltn1Q6A009 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltn1Q6A009 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ltn1Q6A009 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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