Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Thsd7aQ69ZU6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms