Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrcc1Q69ZB0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrcc1Q69ZB0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms