Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms