Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp4Q62445 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sp4Q62445 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms